O Seminário das Missões teve várias ocupações ao longo da história. Conhecido originalmente por Real Colégio das Missões Ultramarinas, foi mandado erigir por D. João VI para preparar os sacerdotes para o Grão Priorado do Crato. Com a extinção das ordens religiosas, assumiu a função de preparação do pessoal missionário para os territórios ultramarinos do Padroado. Após a implantação da República, a torre da igreja do seminário foi destruída e este passou a ser utilizado, embora brevemente, como liceu. Em 1926 voltou a ser propriedade dos padres seculares. Descubra a vasta biblioteca com cerca de 7.300 obras. Entre o acervo encontram-se livros encadernados em madeira e revestidos em pele, bem como exemplares únicos que datam dos séculos XV e XVI. Na igreja do seminário destacam-se o altar-mor de estilo hispano-árabe e o magnífico órgão de fole do séc. XVIII.
O seminário dedica-se também à exploração agrícola, tendo uma larga produção de vinho, a qual comercializa sob a marca “Terras de D. Nuno”.
